精子DNA损伤的病理生理机制被认为与精子染色质包装缺陷、凋亡和氧化应激有关，主要发生在两个阶段：首先在睾丸内，精子DNA要完成复制、染色质浓缩和减数分裂等过程，该过程受到内分泌和基因等综合调控。其次，精细胞进入附睾后，则受到附睾内环境和外环境的双重影响。
精子DNA损伤的主要影响因素包括有年龄、疾病、生活习惯、禁欲时间及生活环境等。
01.年龄：随着男性年龄增长，男性生殖功能、性激素水平、氧化应激反应均可能呈依赖性改变，精子DFI升高风险可能增加。
02.精索静脉曲张：精索静脉曲张时使睾丸内部代谢产物聚集、温度升高，可能通过氧化应激及细胞凋亡途径影响精子DNA的完整性。
03.泌尿生殖系统感染：泌尿生殖系统感染可能会诱导精液中白细胞水平上升、促使炎症介质的释放，从而可能破坏精子结构、增加精子DNA碎片产生可能。
04.吸烟和饮酒：吸烟和饮酒均可能是精子DFI产生的诱导因素。
05.久坐：久坐不动、缺乏锻炼或者运动过度均可能一定程度升高阴囊温度，使精子暴露于氧化应激状态可能增加，进而可能损伤精子DNA。
06.长期熬夜以及接触手机和WIFI等产生的电离辐射等，可能会增加精子线粒体ROS的产生以及DNA氧化加合物的形成，促使精子DNA损伤。
07.取精前禁欲天数可能与精子DNA碎片含量有关。
08.取精方式可能影响精子DNA碎片含量，认为睾丸穿刺取精相比手淫法取精更有可能获得DFI值较低的精子。
09.环境：空气中多环芳烃微粒含量超标，可能会诱导精子DNA突变、增加精子DNA碎片含量；长期接触铅、镉等重金属时，可能会破坏精子DNA的稳定性；有机磷农药和双酚A等均有可能会破坏精子DNA的完整性。
10.其他：沉重的心理压力均可能会破坏精子DNA的完整性。
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